系统已经升级为新的版本，首先也就是最基础的一点，就是融合程度的彻底化。
简单来说，方云和系统已经真正融为一体，对话的媒介依然是大脑。实际上可以看得出来，这是系统的一种自我保护措施；对于方云来说，彻底融合的好处只有一点，那就是不要再闭上眼睛去查看屏幕，确定功能什么的，双方的同步率已经达到了100%，一个念头就能够调出自己所需的所有东西，并且点选自己所有要做的事情。
如此一来，隐蔽性就得到了很大的提高，不再担心会被人看出系统的存在。
功能方面，储物空间的空间获得提升，然并卵，毕竟从一开始就没有装满的情况发生。当然，事实上并没有那么简单，升级之后，储物空间就类似一个储物宝物一样的存在。
也就是说，方云可以把武器装备，甚至是物资什么的都装进去，在必要的时候一个念头，手中就多出了一杆丈八蛇矛，甚至多出了一套铠甲什么的。不考虑惊世骇俗的话，却是挺方便的。尤其是酒菜什么的，放进去什么样子，拿出来就什么样子，以后行军打仗，关键时刻不必担心吃不到热饭菜了。
个人属性版面没有改变，但技能和天赋那里却多出了‘融合’字样。按照系统的说法，两个技能，两个武将技，或者是两个天赋，有五成的概率可以融合出一个更高级的存在，三成概率失败但没有副作用，两成概率融合失败lv降低一级。
当然，这种功能是方云专属，也就是说对系统名单下的其他武将无效。
其次，对于系统界面下的武将，也就是服用过武魂丹，或者成为新建武将的存在，输入其脑中的忠诚潜意识彻底变成死忠程序。也就是说不管方云下达多么荒唐的命令，他们或许会上谏。但上谏无果也会豁出去完成任务，之后也不会掉忠诚度。
也就是说，这批人，将成为自己真正的亲信，就算镇守一方统御数十万人马，也不必担心他们会反叛。
任务系统也得到了升级，失败之后依然会被扣除属性。但难度有所下调，使得方云更加有成功完成的可能性。同时奖励也有所提升。一次获得20点自由属性也不是梦想。
但有一个限制，以后的任务都将与历史挂钩，换言之有些任务必须要到达某些年份，才会出现。当然历史除了大事也有不少小事，这些小事也构成许多支线任务。有意思的是，主线任务失败才会被扣除属性点，支线任务却不存在这样的情况。
显然，有了天子之气的方云，间接也使得系统获得了对抗天道的一些实力。
随着系统的改版。新的主线任务尚未出现，或许是因为188年本来没什么大型战役或者大事件什么的。但支线任务方面，却有所更新：
“支线任务—安插人手，188年（中平5年）八月，刘宏组建西园八校。请宿主在其中安插亲信，每一个成为八校之一的亲信，宿主获得5点自由属性点。青铜抽奖一次（注：两个青铜抽奖可以兑换一次白银抽奖，以此类推）。”
“支线任务—招降，对黑山、白波和益州叛军进行招降，招降一个势力获得2个自由属性点，2个技能点。也可选择消灭他们，每消灭一个势力。则获得1个自有属性点。”
有意思的是，这次升级，也直接补偿了方云5个自由属性点，还有10个技能点。之前战役之后得到15个自由属性点，10个技能点，由于系统升级的关系还没有分配，索性一口气分配下去。